Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ckap2lQ7TS74 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms