Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nphp3Q7TNH6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nphp3Q7TNH6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms