Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd1l2Q7TN88 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd1l2Q7TN88 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms