Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMD7

Dsg4, Desmoglein-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg4Q7TMD7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg4Q7TMD7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg4Q7TMD7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg4Q7TMD7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg4Q7TMD7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg4Q7TMD7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg4Q7TMD7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg4Q7TMD7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg4Q7TMD7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg4Q7TMD7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg4Q7TMD7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dsg4Q7TMD7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Dsg4Q7TMD7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dsg4Q7TMD7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dsg4Q7TMD7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg4Q7TMD7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms