Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY6

Ube2d2b, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2B, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2bQ6ZWY6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2d2bQ6ZWY6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms