Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnih3Q6ZWS4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms