Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ift172Q6VH22 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ift172Q6VH22 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms