Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9K8

Caskin1, Caskin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caskin1Q6P9K8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Caskin1Q6P9K8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Caskin1Q6P9K8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Caskin1Q6P9K8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Caskin1Q6P9K8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Caskin1Q6P9K8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Caskin1Q6P9K8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Caskin1Q6P9K8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Caskin1Q6P9K8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Caskin1Q6P9K8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Caskin1Q6P9K8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Caskin1Q6P9K8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Caskin1Q6P9K8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Caskin1Q6P9K8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Caskin1Q6P9K8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Caskin1Q6P9K8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Caskin1Q6P9K8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Caskin1Q6P9K8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Caskin1Q6P9K8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Caskin1Q6P9K8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Caskin1Q6P9K8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Caskin1Q6P9K8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Caskin1Q6P9K8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Caskin1Q6P9K8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Caskin1Q6P9K8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Caskin1Q6P9K8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Caskin1Q6P9K8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Caskin1Q6P9K8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Caskin1Q6P9K8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Caskin1Q6P9K8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Caskin1Q6P9K8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Caskin1Q6P9K8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Caskin1Q6P9K8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Caskin1Q6P9K8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Caskin1Q6P9K8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Caskin1Q6P9K8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Caskin1Q6P9K8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC27.58■■■□□ 2
Caskin1Q6P9K8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC27.58■■■□□ 2
Caskin1Q6P9K8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Caskin1Q6P9K8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Caskin1Q6P9K8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Caskin1Q6P9K8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms