Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
BC061212Q6P8K3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BC061212Q6P8K3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms