Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam222bQ6P539 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms