Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZB0

Dnajc8, DnaJ homolog subfamily C member 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc8Q6NZB0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnajc8Q6NZB0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dnajc8Q6NZB0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dnajc8Q6NZB0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dnajc8Q6NZB0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dnajc8Q6NZB0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dnajc8Q6NZB0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Dnajc8Q6NZB0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Dnajc8Q6NZB0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dnajc8Q6NZB0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnajc8Q6NZB0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnajc8Q6NZB0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnajc8Q6NZB0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnajc8Q6NZB0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnajc8Q6NZB0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnajc8Q6NZB0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnajc8Q6NZB0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnajc8Q6NZB0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnajc8Q6NZB0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnajc8Q6NZB0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnajc8Q6NZB0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms