Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rprd2Q6NXI6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rprd2Q6NXI6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rprd2Q6NXI6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rprd2Q6NXI6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rprd2Q6NXI6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rprd2Q6NXI6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rprd2Q6NXI6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Rprd2Q6NXI6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rprd2Q6NXI6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rprd2Q6NXI6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rprd2Q6NXI6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Rprd2Q6NXI6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rprd2Q6NXI6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Rprd2Q6NXI6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rprd2Q6NXI6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rprd2Q6NXI6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rprd2Q6NXI6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rprd2Q6NXI6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rprd2Q6NXI6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rprd2Q6NXI6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rprd2Q6NXI6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rprd2Q6NXI6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rprd2Q6NXI6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rprd2Q6NXI6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rprd2Q6NXI6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rprd2Q6NXI6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rprd2Q6NXI6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rprd2Q6NXI6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rprd2Q6NXI6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rprd2Q6NXI6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rprd2Q6NXI6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rprd2Q6NXI6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rprd2Q6NXI6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rprd2Q6NXI6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rprd2Q6NXI6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rprd2Q6NXI6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rprd2Q6NXI6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rprd2Q6NXI6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rprd2Q6NXI6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms