Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atg16l2Q6KAU8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atg16l2Q6KAU8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms