Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn11Q6J756 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn11Q6J756 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms