Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pdzrn3Q69ZS0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdzrn3Q69ZS0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms