Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z98

Brsk2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, mousemouse

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk2Q69Z98 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brsk2Q69Z98 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brsk2Q69Z98 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brsk2Q69Z98 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brsk2Q69Z98 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brsk2Q69Z98 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brsk2Q69Z98 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brsk2Q69Z98 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brsk2Q69Z98 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brsk2Q69Z98 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brsk2Q69Z98 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brsk2Q69Z98 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms