Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nlrp4eQ66X19 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nlrp4eQ66X19 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nlrp4eQ66X19 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nlrp4eQ66X19 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nlrp4eQ66X19 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nlrp4eQ66X19 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Nlrp4eQ66X19 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nlrp4eQ66X19 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nlrp4eQ66X19 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nlrp4eQ66X19 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nlrp4eQ66X19 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nlrp4eQ66X19 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nlrp4eQ66X19 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nlrp4eQ66X19 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nlrp4eQ66X19 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nlrp4eQ66X19 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nlrp4eQ66X19 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nlrp4eQ66X19 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nlrp4eQ66X19 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nlrp4eQ66X19 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nlrp4eQ66X19 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nlrp4eQ66X19 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nlrp4eQ66X19 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nlrp4eQ66X19 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nlrp4eQ66X19 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nlrp4eQ66X19 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nlrp4eQ66X19 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nlrp4eQ66X19 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nlrp4eQ66X19 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nlrp4eQ66X19 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nlrp4eQ66X19 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nlrp4eQ66X19 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nlrp4eQ66X19 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nlrp4eQ66X19 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nlrp4eQ66X19 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nlrp4eQ66X19 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nlrp4eQ66X19 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nlrp4eQ66X19 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nlrp4eQ66X19 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nlrp4eQ66X19 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nlrp4eQ66X19 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nlrp4eQ66X19 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nlrp4eQ66X19 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp4eQ66X19 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms