Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc8eQ66JT1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc8eQ66JT1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms