Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprdQ64487 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PtprdQ64487 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PtprdQ64487 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PtprdQ64487 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PtprdQ64487 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PtprdQ64487 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PtprdQ64487 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PtprdQ64487 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtprdQ64487 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtprdQ64487 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtprdQ64487 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtprdQ64487 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtprdQ64487 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtprdQ64487 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtprdQ64487 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PtprdQ64487 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtprdQ64487 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprdQ64487 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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PtprdQ64487 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprdQ64487 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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PtprdQ64487 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprdQ64487 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprdQ64487 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprdQ64487 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprdQ64487 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprdQ64487 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprdQ64487 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprdQ64487 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprdQ64487 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprdQ64487 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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PtprdQ64487 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprdQ64487 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprdQ64487 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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PtprdQ64487 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprdQ64487 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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PtprdQ64487 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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PtprdQ64487 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprdQ64487 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprdQ64487 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprdQ64487 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
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PtprdQ64487 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprdQ64487 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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PtprdQ64487 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprdQ64487 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprdQ64487 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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PtprdQ64487 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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PtprdQ64487 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
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PtprdQ64487 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprdQ64487 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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