Protein–RNA interactions for Protein: Q64444

Ca4, Carbonic anhydrase 4, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca4Q64444 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ca4Q64444 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ca4Q64444 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms