Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ccdc18Q640L5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Ccdc18Q640L5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ccdc18Q640L5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ccdc18Q640L5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ccdc18Q640L5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ccdc18Q640L5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ccdc18Q640L5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ccdc18Q640L5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ccdc18Q640L5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ccdc18Q640L5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ccdc18Q640L5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Ccdc18Q640L5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ccdc18Q640L5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ccdc18Q640L5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ccdc18Q640L5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ccdc18Q640L5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Ccdc18Q640L5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ccdc18Q640L5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ccdc18Q640L5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ccdc18Q640L5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ccdc18Q640L5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ccdc18Q640L5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ccdc18Q640L5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ccdc18Q640L5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ccdc18Q640L5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ccdc18Q640L5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ccdc18Q640L5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ccdc18Q640L5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ccdc18Q640L5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ccdc18Q640L5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ccdc18Q640L5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Ccdc18Q640L5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ccdc18Q640L5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ccdc18Q640L5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ccdc18Q640L5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ccdc18Q640L5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ccdc18Q640L5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC30.64■■■□□ 2.49
Ccdc18Q640L5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Ccdc18Q640L5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Ccdc18Q640L5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Ccdc18Q640L5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ccdc18Q640L5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Ccdc18Q640L5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ccdc18Q640L5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ccdc18Q640L5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ccdc18Q640L5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ccdc18Q640L5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Ccdc18Q640L5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ccdc18Q640L5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Ccdc18Q640L5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ccdc18Q640L5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ccdc18Q640L5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ccdc18Q640L5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ccdc18Q640L5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ccdc18Q640L5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ccdc18Q640L5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ccdc18Q640L5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ccdc18Q640L5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ccdc18Q640L5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Ccdc18Q640L5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ccdc18Q640L5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ccdc18Q640L5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ccdc18Q640L5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ccdc18Q640L5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ccdc18Q640L5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ccdc18Q640L5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ccdc18Q640L5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ccdc18Q640L5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ccdc18Q640L5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ccdc18Q640L5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ccdc18Q640L5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ccdc18Q640L5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ccdc18Q640L5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ccdc18Q640L5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ccdc18Q640L5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ccdc18Q640L5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ccdc18Q640L5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ccdc18Q640L5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ccdc18Q640L5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Ccdc18Q640L5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ccdc18Q640L5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Ccdc18Q640L5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ccdc18Q640L5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ccdc18Q640L5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ccdc18Q640L5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ccdc18Q640L5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
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