Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ift52Q62559 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ift52Q62559 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms