Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zic2Q62520 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms