Protein–RNA interactions for Protein: Q62288

Spock1, Testican-1, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock1Q62288 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spock1Q62288 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms