Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sema3cQ62181 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sema3cQ62181 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sema3cQ62181 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sema3cQ62181 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Sema3cQ62181 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sema3cQ62181 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sema3cQ62181 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sema3cQ62181 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sema3cQ62181 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sema3cQ62181 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sema3cQ62181 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sema3cQ62181 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sema3cQ62181 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms