Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim27Q62158 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
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