Protein–RNA interactions for Protein: Q61476

Cd55b, Complement decay-accelerating factor transmembrane isoform, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd55bQ61476 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cd55bQ61476 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd55bQ61476 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd55bQ61476 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd55bQ61476 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd55bQ61476 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd55bQ61476 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd55bQ61476 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd55bQ61476 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd55bQ61476 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd55bQ61476 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd55bQ61476 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd55bQ61476 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd55bQ61476 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd55bQ61476 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd55bQ61476 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd55bQ61476 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd55bQ61476 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd55bQ61476 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd55bQ61476 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd55bQ61476 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd55bQ61476 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd55bQ61476 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd55bQ61476 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd55bQ61476 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd55bQ61476 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd55bQ61476 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd55bQ61476 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd55bQ61476 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd55bQ61476 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd55bQ61476 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd55bQ61476 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd55bQ61476 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd55bQ61476 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd55bQ61476 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd55bQ61476 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd55bQ61476 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd55bQ61476 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd55bQ61476 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms