Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vsx2Q61412 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms