Protein–RNA interactions for Protein: Q61080

Foxf1, Forkhead box protein F1, mousemouse

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxf1Q61080 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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Foxf1Q61080 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Foxf1Q61080 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Foxf1Q61080 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Foxf1Q61080 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Foxf1Q61080 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Foxf1Q61080 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxf1Q61080 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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