Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc1Q61056 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms