Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp4Q60972 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms