Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Meis1Q60954 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Meis1Q60954 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms