Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Neurod1Q60867 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Neurod1Q60867 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Neurod1Q60867 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Neurod1Q60867 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Neurod1Q60867 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Neurod1Q60867 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Neurod1Q60867 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Neurod1Q60867 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Neurod1Q60867 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Neurod1Q60867 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Neurod1Q60867 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Neurod1Q60867 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Neurod1Q60867 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Neurod1Q60867 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Neurod1Q60867 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Neurod1Q60867 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Neurod1Q60867 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Neurod1Q60867 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Neurod1Q60867 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Neurod1Q60867 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Neurod1Q60867 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Neurod1Q60867 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Neurod1Q60867 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Neurod1Q60867 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Neurod1Q60867 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Neurod1Q60867 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Neurod1Q60867 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Neurod1Q60867 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Neurod1Q60867 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Neurod1Q60867 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Neurod1Q60867 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Neurod1Q60867 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Neurod1Q60867 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Neurod1Q60867 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Neurod1Q60867 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Neurod1Q60867 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Neurod1Q60867 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Neurod1Q60867 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Neurod1Q60867 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Neurod1Q60867 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Neurod1Q60867 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Neurod1Q60867 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Neurod1Q60867 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Neurod1Q60867 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Neurod1Q60867 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Neurod1Q60867 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Neurod1Q60867 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Neurod1Q60867 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Neurod1Q60867 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Neurod1Q60867 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Neurod1Q60867 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Neurod1Q60867 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Neurod1Q60867 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Neurod1Q60867 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Neurod1Q60867 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Neurod1Q60867 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Neurod1Q60867 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Neurod1Q60867 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Neurod1Q60867 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Neurod1Q60867 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Neurod1Q60867 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Neurod1Q60867 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Neurod1Q60867 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Neurod1Q60867 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Neurod1Q60867 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Neurod1Q60867 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Neurod1Q60867 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Neurod1Q60867 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Neurod1Q60867 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms