Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stxbp3Q60770 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stxbp3Q60770 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stxbp3Q60770 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stxbp3Q60770 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stxbp3Q60770 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stxbp3Q60770 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stxbp3Q60770 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stxbp3Q60770 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stxbp3Q60770 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stxbp3Q60770 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stxbp3Q60770 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stxbp3Q60770 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stxbp3Q60770 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stxbp3Q60770 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stxbp3Q60770 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Stxbp3Q60770 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stxbp3Q60770 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stxbp3Q60770 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stxbp3Q60770 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stxbp3Q60770 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stxbp3Q60770 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Stxbp3Q60770 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Stxbp3Q60770 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stxbp3Q60770 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stxbp3Q60770 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stxbp3Q60770 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Stxbp3Q60770 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stxbp3Q60770 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stxbp3Q60770 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stxbp3Q60770 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Stxbp3Q60770 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Stxbp3Q60770 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stxbp3Q60770 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms