Protein–RNA interactions for Protein: Q5U462

Cdcp1, CUB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdcp1Q5U462 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdcp1Q5U462 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdcp1Q5U462 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdcp1Q5U462 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms