Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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Vmn1r195Q5SVD6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Vmn1r195Q5SVD6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Vmn1r195Q5SVD6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Vmn1r195Q5SVD6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Vmn1r195Q5SVD6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Vmn1r195Q5SVD6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Vmn1r195Q5SVD6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Vmn1r195Q5SVD6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Vmn1r195Q5SVD6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Vmn1r195Q5SVD6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Vmn1r195Q5SVD6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Vmn1r195Q5SVD6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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