Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.4 ms