Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbm27Q5SFM8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbm27Q5SFM8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbm27Q5SFM8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rbm27Q5SFM8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rbm27Q5SFM8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rbm27Q5SFM8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rbm27Q5SFM8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rbm27Q5SFM8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rbm27Q5SFM8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rbm27Q5SFM8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rbm27Q5SFM8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rbm27Q5SFM8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rbm27Q5SFM8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbm27Q5SFM8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbm27Q5SFM8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbm27Q5SFM8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbm27Q5SFM8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbm27Q5SFM8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbm27Q5SFM8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbm27Q5SFM8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbm27Q5SFM8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbm27Q5SFM8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbm27Q5SFM8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms