Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trdv4Q5R1A3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms