Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scarf1Q5ND28 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scarf1Q5ND28 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms