Protein–RNA interactions for Protein: Q5M8N4

Sdr39u1, Epimerase family protein SDR39U1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr39u1Q5M8N4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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