Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Fam220aQ3ZN08 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Fam220aQ3ZN08 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Fam220aQ3ZN08 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Fam220aQ3ZN08 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Fam220aQ3ZN08 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Fam220aQ3ZN08 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Fam220aQ3ZN08 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam220aQ3ZN08 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam220aQ3ZN08 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam220aQ3ZN08 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam220aQ3ZN08 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam220aQ3ZN08 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam220aQ3ZN08 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam220aQ3ZN08 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam220aQ3ZN08 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam220aQ3ZN08 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam220aQ3ZN08 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam220aQ3ZN08 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam220aQ3ZN08 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam220aQ3ZN08 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam220aQ3ZN08 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam220aQ3ZN08 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam220aQ3ZN08 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam220aQ3ZN08 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam220aQ3ZN08 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam220aQ3ZN08 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam220aQ3ZN08 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam220aQ3ZN08 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam220aQ3ZN08 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Fam220aQ3ZN08 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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