Protein–RNA interactions for Protein: Q3V209

Tmub2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub2Q3V209 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmub2Q3V209 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmub2Q3V209 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms