Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnaaf3Q3UYV8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnaaf3Q3UYV8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnaaf3Q3UYV8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnaaf3Q3UYV8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnaaf3Q3UYV8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnaaf3Q3UYV8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnaaf3Q3UYV8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnaaf3Q3UYV8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnaaf3Q3UYV8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnaaf3Q3UYV8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnaaf3Q3UYV8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf3Q3UYV8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf3Q3UYV8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf3Q3UYV8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf3Q3UYV8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf3Q3UYV8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf3Q3UYV8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf3Q3UYV8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf3Q3UYV8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf3Q3UYV8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf3Q3UYV8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf3Q3UYV8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf3Q3UYV8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf3Q3UYV8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf3Q3UYV8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf3Q3UYV8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf3Q3UYV8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf3Q3UYV8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf3Q3UYV8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf3Q3UYV8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf3Q3UYV8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnaaf3Q3UYV8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnaaf3Q3UYV8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnaaf3Q3UYV8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnaaf3Q3UYV8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnaaf3Q3UYV8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnaaf3Q3UYV8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnaaf3Q3UYV8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnaaf3Q3UYV8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnaaf3Q3UYV8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnaaf3Q3UYV8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnaaf3Q3UYV8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnaaf3Q3UYV8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnaaf3Q3UYV8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms