Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc160Q3UYG1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms