Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Znf48Q3US17 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Znf48Q3US17 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Znf48Q3US17 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Znf48Q3US17 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Znf48Q3US17 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf48Q3US17 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms