Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisa3Q3UPR0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisa3Q3UPR0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisa3Q3UPR0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisa3Q3UPR0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisa3Q3UPR0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisa3Q3UPR0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisa3Q3UPR0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa3Q3UPR0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa3Q3UPR0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa3Q3UPR0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa3Q3UPR0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa3Q3UPR0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa3Q3UPR0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa3Q3UPR0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa3Q3UPR0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa3Q3UPR0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa3Q3UPR0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa3Q3UPR0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa3Q3UPR0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa3Q3UPR0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa3Q3UPR0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisa3Q3UPR0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Shisa3Q3UPR0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shisa3Q3UPR0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shisa3Q3UPR0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shisa3Q3UPR0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shisa3Q3UPR0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa3Q3UPR0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms