Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPP8

Cep63, Centrosomal protein of 63 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep63Q3UPP8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cep63Q3UPP8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cep63Q3UPP8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cep63Q3UPP8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cep63Q3UPP8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cep63Q3UPP8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cep63Q3UPP8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cep63Q3UPP8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cep63Q3UPP8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cep63Q3UPP8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cep63Q3UPP8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cep63Q3UPP8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cep63Q3UPP8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cep63Q3UPP8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms