Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Skap2Q3UND0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Skap2Q3UND0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms