Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cln5Q3UMW8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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